Après le soulèvement de juillet 1936, Hondarribia resta dans la zone fidèle à la République. Face à l’avancée des colonnes du colonel Beorlegui sur Irún, de nombreuses personnes embarquèrent depuis son port vers la voisine Hendaye, tant des sympathisants de droite fuyant les possibles représailles de groupes extrémistes que des combattants et des civils de toutes sortes s’exilant devant l’arrivée des troupes attaquantes.
L’occupation de la ville par les forces de Beorlegui eut lieu le 6 septembre 1936, un jour après la chute d’Irún. Voir GUADALUPE.