Irun eta Pasaia banandu egin dira. Irungo Unibertsitatea 1766an banandu zen Hondarribiko jurisdikziotik, eta Pasaiako San Joan auzoa 1767an. Handik aurrera, Hondarribiko antzinako terminoa egun horretako lurraldera eta Konbentzioko gerrara murriztuzen. 1793ko apirilaren 23an, Hendaiako gotorlekua suntsitu zuten Hondarribia kaletik. Hau, era berean, hurrengo urteko uztailean bonbardatu zuten eta gero bere terminoan sartu. 1794ko abuztuaren 1ean, Frantziak aurrera egin zuenean, Hondarribia izendatu zuen. Frantziako armadak han jaso du:
| 2.000 | preso |
| 200 | kanoiak |
| 10.000 eta 12.000 bitarte | fusilak |
| 1.500 - 1.600 | kanpin-dendak |
| 4.000 | ponpak, obusak eta balak |
| 30-40 bitarte | arrantzale-txalupak |
| 3.- | bi mastako nabeak |
| 1. | ongi ekipatutako kanoi-kaxa |
Ez zuen ebakuatu irailean bakea egin zen arte, eta, orduan ere, jauregia irauli ondoren, haren harresi indartsuak eta harresiak, batez ere Hendaiara begiratzen duen zatikoak. Madrilgo Gazetak bere alkatearen, Joaquín de Irarreta alkatearen, gainerako kapitularren eta hiri horretako bizilagun batzuen eraginei esleitu zien plaza ematea. Horretarako, ofizial orokorren gerra-kontseilua egin zen Iruñean. Haien portaera aztertu ondoren, Kontseiluak adierazi zuen alkate, kapitular eta auzotar horiek ahal zuten guztia lagundu zutela errendimendua luzatu etaeragozteko. Irun, 1801. Berriro ere irundarrak eta hondarribiarrak izan ziren 1801ean, Toscanako erregeen igarotzeagatik. Maiatzaren 28ko Errege Aginduaren bidez, batek eta besteak oraingo honetan gertatutakoa elkarri ahazteko agindu zen, denboraren poderioz beste bat aurkezten bada, erregeak aldez aurretik erabakiko baitzuen aipatutako partikularraren gainean izan zuten eskubidea.