En 1898 se constituyó el colegio de farmacéuticos de Bizkaia, siendo elegido como Presidente D. Diego Espada y Fonseca. Las cuotas generales se fijaron en 5 pesetas la de ingreso y 15 pesetas la cuota anual. Un año después de su nacimiento ya contaba con 91 colegiados. Desde sus comienzos contó con el apoyo y colaboración de la Academia de Ciencias Médicas de Bilbao, con quien compartieron sede durante varios años, y de la que también llegó a ser Presidente D. Diego Espada.
Bizkaia es el territorio con mayor número de farmacias y colegiados. En 1881 había 40 farmacias, 95 en 1897, 114 en 1931 y casi cuatro veces más (405) en 1991. En 1999 había 422 farmacias y 1185 colegiados, y 10 años después 432 farmacias y 1589 colegiados (316 hombres y 1273 mujeres).
Los actuales Estatutos fueron aprobados en 2008 mediante Orden del Consejero de Justicia, Trabajo y Seguridad Social.