El sábado 5 de febrero de 1565, la escuadra navegaba hacia las islas del Poniente -Filipinas-. Diez días después llegaba a la isla de Samar, situada en el exterior del archipiélago, hacia Guam. El binomio Legazpi-Urdaneta había seguido parte de la ruta de Magallanes-Elcano de hacía 45 años. El alférez Mayor Andrés de Ibarra tomó posesión de la isla previo acuerdo con un indígena principal, usando los rituales de rigor. Los intentos pacíficos de abastecerse fracasaban a pesar del buen trato de Legazpi y de los obsequios repartidos. E1 20 de febrero de 1565 zarpó la escuadra y al día siguiente llegaba a Leite. A pesar de la hostilidad de sus habitantes, Legazpi tomó posesión de la tierra con toda solemnidad, levantando la acostumbrada acta. Las exploraciones del capitán Goiti, Urdaneta y el maestre de campo habían dado con un puerto llamado Carvallán a donde llegaron el día 5 de marzo. El problema del abastecimiento seguía grave. La política pacífica sólo daría frutos en Bohol.