Vegetación y fauna. G. Viers observó hace mucho tiempo (1966) que los Pirineos no tienen unidad climática. Algo de eso, aunque a mucho menor escala, ocurre con los Pirineos Occidentales Atlánticos donde se halla el tramo vasco y su prolongación natural cantábrica. También aquí el entrecruzamiento de influencias oceánicas y la mayor o menor dominancia de éstas, así como la calidad del suelo calcáreo o granítico han dado lugar a variaciones del manto vegetal y de su correlato faunístico. Tanto al Norte como al Sur de la zona axial el complejo colino, el piso montañoso, el subalpino y la cota alpina poseen, sin embargo, rasgos comunes que son los que en este artículo cabe reseñar.
Hay que decir, asimismo, que el paisaje alpino de alta montaña sólo puede contemplarse en el Roncal (Larra, Belagua) y en la Alta Zuberoa, a partir de los cuales el Pirineo Vasco desciende y cambia convirtiéndose, pese a su corte y a su pendiente, en montaña media muy cubierta de vegetación bastante homogénea a ambos lados del Pirineo. Tal vez haya que decir que en la zona Norte se combinan los elementos atlánticos y los continentales sobre suelo mucho más ácido, dando lugar a un nivel colino más variado que en el Sur donde la influencia mediterránea es importante.
Las grandes unidades ambientales naturales del Pirineo vasco pueden clasificarse así:a) Comunidad alpina. Comprende roquedos, acantilados y prado alpino, musgos, líquenes y algún pinar de elementos diseminados. Suele hallarse en esta Zona el edelwais y la azalea silvestre y en cuanto a la fauna el observador afortunado podrá encontrar ejemplares de perdiz nival, urogallos, carpinteros dorsiblancos, mirlo capiblanco, gorrión alpino, armiño, carpinteros, etc. Muchos de estos animales tienen en Larra el extremo occidental de su hábitat pirenaico.b) Pinares. Bordean la zona alpina supraforestal y constituyen manchas compactas, en especial en el extremo oriental, de pino negro y pino albar. En ésta y en la zona anterior más apacible se alojan los sarrios, los últimos osos, los jabalíes y planean en lo alto el buitre, el quebrantahuesos y el águila real. En los ríos se alojan las truchas y el rarísimo desmán.c) Hayedo-abetal. Constituye una zona tupida -en recesión- y protectora de vida animal: carpinteros, reyezuelos, ciervos, alguna nutria. Es de destacar el gran hayedo de Irati, verdadero jardín natural, y los de la vertiente Norte. A partir de esta zona forestal y ya descendiendo al valle hallamos los pastizales, la zona de matorral y landa, el fondo de valle cultivado y la comunidad fluvial. Recordemos finalmente que, desde el Terciario, tanto la flora como la fauna han experimentado cambios, razón por la que es difícil saber con exactitud si éstas son endémicas del todo. A ello hay que añadir el exterminio de muchas especies tales como el lobo (el último fue muerto en 1981), el visón, el oso (casi desaparecido), el lince boreal, la marmota y el gato montés, víctimas de la presión demográfica y de la indiferencia y/o crueldad humana. También conviene recordar que, faltas del otrora abundante ganado, las rapaces emigran a la Foz de Arbaiun o a las Bardenas, y que de la zona pirenaica provienen los pottokak, caballitos pirenaicos semisalvajes que pastan en el monte guipuzcoano, suletino y bajonavarro, el gran mastín, blanco o marrón claro, y los perros pastores. ver PERRO.