Forma parte desde antiguo del valle de Arraia y como tal fue señorío de los Gaona, por merced de Enrique II de Castilla a Juan Ruiz de Gaona en 1369. En 1589 revierte Vírgala a la Corona al morir sin sucesión Pedro de Gaona. En 1632 vuelve a ser señorío al ser comprada por Diego Sánchez de Samaniego y Gamarra, permaneciendo en el señorío de los Samaniego hasta el s. XIX.