Catedrático de lingüística en la Universidad de Maryland desde 1989.
Licenciado en Filología por la Universidad de Deusto y doctor en lingüística por la Universidad de Connecticut. Su trabajo se centra en la bio-lingüística, un acercamiento a la facultad del lenguaje humano desde el punto de vista de las ciencias naturales.
Uriagereka ha sido director del Programa Graduado en Maryland y profesor visitante en diez universidades de Europa y América. Ha obtenido cuatro proyectos de la National Science Foundation y diversos reconocimientos, entre ellos el premio Euskadi de Investigación en el año 2001, y en 1998 el premio al mejor libro profesional en lengua de American Association of Publishers, por Rhyme and Reason (traducido como Pies y Cabeza, Visor 2005). Uriagereka ha publicado seis libros como autor o co-autor y dos como editor, ochenta artículos o capítulos profesionales, y ha dado más de doscientas charlas en cuatro continentes.
En su labor como mentor, Uriagereka ha dirigido veinte tesis doctorales y ha colaborado en el comité de cuarenta y cinco más. Es miembro de varios paneles científicos y consejos editoriales (entre ellos Syntax, Probus, el Centro para Sistemas Complejos Dinámicos de Potsdam, el proyecto Asimetría de la Universidad de Québec en Montreal, y la fundación ICREA). También colabora como escritor con el grupo interdisciplinario Musica Aperta, de Washington, que ha representado dos de sus creaciones en el Langsburgh Theatre, y ha sido galardonado en el año 2000, junto a su co-autor Javier Díez, con el Premio Pereda de novela corta por La Comandita.
Salaberria, Urkiri "Juan Uriagereka. Odio las definiciones". Euskonews ; 472. Donostia : Eusko Ikaskuntza, 2009.