Honores para toda una vida entregada a la investigación. En 1964, la Real Sociedad Bascongada de los Amigos del País le nombró socio con todos los honores. Un año más tarde, en 1965, fue nombrado académico correspondiente de Euskaltzaindia, recibiendo en 1979 el título de Académico de Honor por parte de la misma Real Academia de la Lengua Vasca. En 1982, junto con Odón de Apraiz, recibió un caluroso homenaje en Aramaio. En 1983 fueron sus amigos de Apellániz quienes mostraron su agradecimiento dedicándole su nombre a la plaza del pueblo. También en 1983, el Ayuntamiento de Vitoria le concedió la "Medalla de Oro de la Ciudad". En 1990, Eusko Ikaskuntza decidió concederle el premio "Manuel Lekuona" por su aportación total "opera omnia" a la cultura vasca. Un colegio público de la ciuadad de Vitoria lleva su nombre y una de las salas del Archivo del Territorio Histórico de Álava (ATHA) también tiene su nombre.