Aforada por Alfonso el Batallador. En fecha discutida por los autores, establecida por J. M. Lacatra y admitida por la historioriografía más rigurosa moderna en 1110, Alfonso I el Batallador, rey de Navarra y Aragón, otorga Fuero a Funes, Marcilla y Peñalén:
"In nomine patris, et filii, et spiritus sancti, amen. Ego Aldefonsus Dei gratia, imperator facio hanc cartam donacionis simul et ingenuitatis, ad vos totos homines de Funes, et de Marcella, et de Pennalene, á totos varones, mulieres, maiores et minores, placuit mihi libenti animo et spontanea voluntate, propter servicia que mihi fecistis, et quia stetis totfa hora in mea fidelitate, et fuistis mecum fideles, dono et concedo vobis, quod habeatis tales foros, et tales usaticos quales habent homines de Calagorra, et quod non habeatis, nec faciatis nullos alios fueros, nisi tales quales habebant, et faciebant homines de Calagorram, die quando ista carta fuit facta, et similiter concedo et confirmo vobis quod totos illos homines de Calagorra, et de totas alias terras veniant vobis ad judicium ad extremum et ad caput de vestros terminos, et ut vos tofa hora stetis in mea fidelitate. Hoc autem donativum, sicut superius ditum est laudo, et concedo, et confirmo vobis illud, quod ita firmiter permaneat, et quod habeatis, et posideatis illud totum ingenuum, liberum, et firmum, et salvum vos, et filii vestri, et omnis generatio, vel posteritas vestra, salva mea fidelitate, et de omni posteritate per cuncta seculorum secula amen. Signum Adefonsi. Ego Garcias rex hoc signum facio et supra scripta confirmo et ingenuo vobis totos illos alios malos fueros, que habeatis scilicet illos quos habebant homines de Calagorra. Signum regis Sancii dono etiam ad homines de Funes, que comparent infanzones hereditates de laboratores, et laboratores de infanzones, foras que non mactent foco. Facta ista carta era MCLVIII (fecha mal transcrita por Muñoz y Romero) in mense Julio in illa horta de Alagone, regnante Dei gratia in Aragone et Pampilona in Suprarvin et Ripacrucia et in Castella. Episcopus Stephanus in Osca. Episcopus Petrus in Irunea. Episcopus Reymundus in Barbastro. Sinnor Azenar Aezenarez, in Funes, et in Arquedas. Seinnior Aiminio Fortingones in Peralta. Seinnior Enneco Ximiniones in Lampezo. Seinnior García Lopiz in Marañone. Don Didaco Lopis in Nagera. D. Redimiro in Montison. D. Calbet in Eslon. Sinnior Eneco Sanchez in Cascant. Seinnor Fortunno Garcieiz de Viele, maiordomo de rege. Garcia Johannes merino in Funes. Ego Santius sub jussione domini regis hanc cartam scripsi, et de manu mea hoc signum feci".
Fundación cisterciense. En 1160, Sancha de León, hija de Alfonso VII de Castilla y León, mujer de Sancho VI el Sabio de Navarra, funda en Marcilla un convento cisterciense de monjas bernardas, cuya donación se verá confirmada por el rey navarro en 1181 . Posteriormente, Teobaldo II y Carlos el Malo confirmarían de nuevo sus privilegios. En el reinado de Carlos III, a instancias de Mosen Pierres de Peralta, el establecimiento cisterciense fue suprimido y anexionado a La Oliva.
Marcilla en Las Navas de Tolosa. Según reseña Altadill, Marcilla participó destacadamente en la batalla de Las Navas de Tolosa (1212). Las tropas de la villa llevaban a su cabeza al capitán Fermín de Marcilla, combatiendo al lado de Sancho el Fuerte, quien les otorgó el privilegio de llevar en sus armas las cadenas, pieza heráldica navarra que tiene su origen en la jornada de las Navas.
Señorío de Mosen Pierres de Peralta. En 1429, Juan II de Navarra otorga el señorío de la villa de Marcilla a Mosen Pierres de Peralta, cabeza del marquesado de Falces.
Defensa contra Castilla de la plaza de Marcilla. En 1516, tras la conquista de Navarra por Fernando el Católico cuatro años antes, para frenar el intento de Juan de Albret de reconquistar el reino, el cardenal Cisneros, regente de Castilla, manda destruir todos los castillos y plazas fuertes de Navarra, a excepción de Iruña. La orden debería cumplirla el nuevo virrey, Antonio Manrique, duque de Nájera. La plaza de Marcilla por la decisión de Ana de Velasco, marquesa de Falces y señora de Marcilla, resistió eficazmente al asedio del coronel Villalva, quien mandaba la columna que recorrió Navarra en su labor de destrucción de las fortalezas.
Guerra de Sucesión española. Durante la guerra de Sucesión española Navarra se mantuvo fiel a Felipe V. Sin embargo las tropas del pretendiente archiduque Carlos ocuparon en el año 1710 parte del reino y Marcilla también se vio amenazada, según refiere Idoate en Rincones..., t. I, pág. 124. El 28 de septiembre del citado año Marcilla solicita socorro a la diputación, ante la proximidad de las fuerzas enemigas. A finales del mismo año el conde de Melún expulsa con sus tropas a las del pretendiente, quedando definitivamente Navarra a favor del rey Felipe V.
Antecedentes de la abolición de los señoríos. En virtud de lo decretado por las Cortes de Cádiz en el año 1811 , respecto a la abolición de los "privilegios exclusivos, privativos y prohibitivos procedentes de señorío", en Marcilla se procedió en consecuencia en junio de 1820, según refiere Idoate en Rincones..., t. II, págs. 101 y 102. Se quitó del presbiterio de la iglesia parroquial una silla perteneciente a la marquesa de Falces y un banco para sus criados, ocupando desde entonces el lugar de preeminencia los miembros del ayuntamiento. Así mismo se procedió a demoler un pequeño fortín perteneciente a la citada marquesa. De todo ello dio parte el alcalde a la superioridad.
Guerra de 1936-1939. Como consecuencia de la represión fueron asesinadas 39 personas de esta localidad: Dámaso Alonso Pavía, Daniel Antomas Osés, José Aparicio Capote, Pablo Bengoechea Garrido, Valentín Bolea Díaz, Justo Boneta Romero, Jesús Cambra Estarriaga, José Castillejo Pinillos, Lucio Cristóbal Bretos, Cecilio Charral Goñi, Jesús Díaz Lafraya, Pedro Díaz Ruiz, Bienvenido Elorz Arbizu, Enrique Fabo Briones, José Fabo Briones, Justino Fabo Lozano, Emilio Fernández Pardo, Eustaqui García Méndez, Marino García Méndez, Venancio García Sobejano, Manuel Gómez Pozo, Máximo Goñi Boneta, Julián Hernández Minguillón, Saturnino Hernández Suescun, Eugenio Inchausti Garrido, Marcelino Jiménez Navarro, Lucio Laparra Murugarren, Rufo Macua García, Cecilio Mañas Ratia, Leoncio Marín Malo, Pedro Marín Malo, Nicolasa Martínez Fernández, Valentín Nicolay Charral, Araceli Peña Malo, Timoteo Peña Nicolay, Pascual Pérez Láinez, Demetrio Suescun Suberbiola, José Villava García y tres valencianos. (Ref. NGI).
"In nomine patris, et filii, et spiritus sancti, amen. Ego Aldefonsus Dei gratia, imperator facio hanc cartam donacionis simul et ingenuitatis, ad vos totos homines de Funes, et de Marcella, et de Pennalene, á totos varones, mulieres, maiores et minores, placuit mihi libenti animo et spontanea voluntate, propter servicia que mihi fecistis, et quia stetis totfa hora in mea fidelitate, et fuistis mecum fideles, dono et concedo vobis, quod habeatis tales foros, et tales usaticos quales habent homines de Calagorra, et quod non habeatis, nec faciatis nullos alios fueros, nisi tales quales habebant, et faciebant homines de Calagorram, die quando ista carta fuit facta, et similiter concedo et confirmo vobis quod totos illos homines de Calagorra, et de totas alias terras veniant vobis ad judicium ad extremum et ad caput de vestros terminos, et ut vos tofa hora stetis in mea fidelitate. Hoc autem donativum, sicut superius ditum est laudo, et concedo, et confirmo vobis illud, quod ita firmiter permaneat, et quod habeatis, et posideatis illud totum ingenuum, liberum, et firmum, et salvum vos, et filii vestri, et omnis generatio, vel posteritas vestra, salva mea fidelitate, et de omni posteritate per cuncta seculorum secula amen. Signum Adefonsi. Ego Garcias rex hoc signum facio et supra scripta confirmo et ingenuo vobis totos illos alios malos fueros, que habeatis scilicet illos quos habebant homines de Calagorra. Signum regis Sancii dono etiam ad homines de Funes, que comparent infanzones hereditates de laboratores, et laboratores de infanzones, foras que non mactent foco. Facta ista carta era MCLVIII (fecha mal transcrita por Muñoz y Romero) in mense Julio in illa horta de Alagone, regnante Dei gratia in Aragone et Pampilona in Suprarvin et Ripacrucia et in Castella. Episcopus Stephanus in Osca. Episcopus Petrus in Irunea. Episcopus Reymundus in Barbastro. Sinnor Azenar Aezenarez, in Funes, et in Arquedas. Seinnior Aiminio Fortingones in Peralta. Seinnior Enneco Ximiniones in Lampezo. Seinnior García Lopiz in Marañone. Don Didaco Lopis in Nagera. D. Redimiro in Montison. D. Calbet in Eslon. Sinnior Eneco Sanchez in Cascant. Seinnor Fortunno Garcieiz de Viele, maiordomo de rege. Garcia Johannes merino in Funes. Ego Santius sub jussione domini regis hanc cartam scripsi, et de manu mea hoc signum feci".
Fundación cisterciense. En 1160, Sancha de León, hija de Alfonso VII de Castilla y León, mujer de Sancho VI el Sabio de Navarra, funda en Marcilla un convento cisterciense de monjas bernardas, cuya donación se verá confirmada por el rey navarro en 1181 . Posteriormente, Teobaldo II y Carlos el Malo confirmarían de nuevo sus privilegios. En el reinado de Carlos III, a instancias de Mosen Pierres de Peralta, el establecimiento cisterciense fue suprimido y anexionado a La Oliva.
Marcilla en Las Navas de Tolosa. Según reseña Altadill, Marcilla participó destacadamente en la batalla de Las Navas de Tolosa (1212). Las tropas de la villa llevaban a su cabeza al capitán Fermín de Marcilla, combatiendo al lado de Sancho el Fuerte, quien les otorgó el privilegio de llevar en sus armas las cadenas, pieza heráldica navarra que tiene su origen en la jornada de las Navas.
Señorío de Mosen Pierres de Peralta. En 1429, Juan II de Navarra otorga el señorío de la villa de Marcilla a Mosen Pierres de Peralta, cabeza del marquesado de Falces.
Defensa contra Castilla de la plaza de Marcilla. En 1516, tras la conquista de Navarra por Fernando el Católico cuatro años antes, para frenar el intento de Juan de Albret de reconquistar el reino, el cardenal Cisneros, regente de Castilla, manda destruir todos los castillos y plazas fuertes de Navarra, a excepción de Iruña. La orden debería cumplirla el nuevo virrey, Antonio Manrique, duque de Nájera. La plaza de Marcilla por la decisión de Ana de Velasco, marquesa de Falces y señora de Marcilla, resistió eficazmente al asedio del coronel Villalva, quien mandaba la columna que recorrió Navarra en su labor de destrucción de las fortalezas.
Guerra de Sucesión española. Durante la guerra de Sucesión española Navarra se mantuvo fiel a Felipe V. Sin embargo las tropas del pretendiente archiduque Carlos ocuparon en el año 1710 parte del reino y Marcilla también se vio amenazada, según refiere Idoate en Rincones..., t. I, pág. 124. El 28 de septiembre del citado año Marcilla solicita socorro a la diputación, ante la proximidad de las fuerzas enemigas. A finales del mismo año el conde de Melún expulsa con sus tropas a las del pretendiente, quedando definitivamente Navarra a favor del rey Felipe V.
Antecedentes de la abolición de los señoríos. En virtud de lo decretado por las Cortes de Cádiz en el año 1811 , respecto a la abolición de los "privilegios exclusivos, privativos y prohibitivos procedentes de señorío", en Marcilla se procedió en consecuencia en junio de 1820, según refiere Idoate en Rincones..., t. II, págs. 101 y 102. Se quitó del presbiterio de la iglesia parroquial una silla perteneciente a la marquesa de Falces y un banco para sus criados, ocupando desde entonces el lugar de preeminencia los miembros del ayuntamiento. Así mismo se procedió a demoler un pequeño fortín perteneciente a la citada marquesa. De todo ello dio parte el alcalde a la superioridad.
Guerra de 1936-1939. Como consecuencia de la represión fueron asesinadas 39 personas de esta localidad: Dámaso Alonso Pavía, Daniel Antomas Osés, José Aparicio Capote, Pablo Bengoechea Garrido, Valentín Bolea Díaz, Justo Boneta Romero, Jesús Cambra Estarriaga, José Castillejo Pinillos, Lucio Cristóbal Bretos, Cecilio Charral Goñi, Jesús Díaz Lafraya, Pedro Díaz Ruiz, Bienvenido Elorz Arbizu, Enrique Fabo Briones, José Fabo Briones, Justino Fabo Lozano, Emilio Fernández Pardo, Eustaqui García Méndez, Marino García Méndez, Venancio García Sobejano, Manuel Gómez Pozo, Máximo Goñi Boneta, Julián Hernández Minguillón, Saturnino Hernández Suescun, Eugenio Inchausti Garrido, Marcelino Jiménez Navarro, Lucio Laparra Murugarren, Rufo Macua García, Cecilio Mañas Ratia, Leoncio Marín Malo, Pedro Marín Malo, Nicolasa Martínez Fernández, Valentín Nicolay Charral, Araceli Peña Malo, Timoteo Peña Nicolay, Pascual Pérez Láinez, Demetrio Suescun Suberbiola, José Villava García y tres valencianos. (Ref. NGI).