Este pueblo fue aforado por el rey Don Sancho el Fuerte en 1210. En 1430 fue libertado de cuarteles e imposiciones porque los castellanos robaron a sus habitantes. Según refiere Idoate en Rincones... (t. II, pág. 373) en el primer tercio del siglo XV, los guipuzcoanos arrasaron y quemaron la Burunda y el valle de Arakil, llegando en sus incursiones hasta Izurdiaga. Un documento real del año 1431 concedió rebaja en el pago del impuesto de cuarteles a los pueblos afectados, para ayudarles a recuperarse de las pérdidas sufridas. Según refiere Idoate en Rincones... (t. II, pág. 255) los frailes del monasterio de Iranzu cobraban al concejo de Izurdiaga una pecha anual de un cuartal de trigo y otro de cebada, como se desprende de un inventario de los bienes del monasterio, efectuado en el año 1582. El 24 de junio del año 1813, los franceses saquearon Izurdiaga. Este saqueo, así como otros perpetrados en Navarra ese mismo día, fue a causa de la derrota sufrida tres días antes por los ejércitos napoleónicos en Vitoria, por cuyo motivo los franceses estaban encolerizados. En cumplimiento de la ley de desamortización del 1 de mayo de 1855 se vendieron en esta localidad, en 1882, dos casas y 32 fincas (Ref. R. G. CH. «La D. C. en N.»).