El club Pamplona Atlético surge en el año 1980. En el se integran los atletas del CAUN (que desaparece) y la mayor parte de los atletas del club GAIN. El resto se integrarían durante la temporada siguiente. La idea inicial es integrar en un solo club a los mejores atletas navarros y olvidar las rencillas entre el club CAUN y el Amaya y posteriormente con el GAIN. Desde su formación ha sido el club más importante navarro y sin duda el mejor club navarro de la historia. Desde la temporada 1997-98 su principal patrocinador es la empresa de vehículos sueca Scania. Por sus filas han pasado la mayor parte de los mejores atletas navarros de las últimas décadas con muy pocas excepciones y estas siempre en pruebas de fondo. Tres de sus atletas han participado en Juegos Olímpicos. Estos son: Gregoria Ferrer en Barcelona, Iñigo Monreal en Atlanta y Sidney y Marta Mendia en Sidney y Atenas. El número de atletas internacionales en la historia del club es numerosísimo así como la cantidad de medallas logradas en los diversos campeonatos de España por categorías. En los campeonatos de España individuales absolutos los atletas representando al Pamplona Atlético han obtenido un total de 143 medallas divididas en 30 de oro, 56 de plata y 57 de bronce. Asimismo en los campeonatos de España de relevos por clubes el Pamplona Atlético ha ganado un total de 20 medallas de las cuales una fue de oro (4x100 m.l. femenino), 11 de plata y 8 de bronce.
Destaca también el título de campeón de España por clubes júnior femenino en 1988.
En la prueba oficiosa denominada Campeonato de Europa de relevos por clubes celebrada en la localidad danesa de Aarhus el equipo femenino del club en la prueba de 4x100 m.l. logró la medalla de oro y por tanto el título continental.
En cuanto a la participación en las Ligas de clubes de España el Pamplona Atlético ha participado desde el año de su creación en todas sus ediciones. El equipo femenino ha participado en 24 temporadas en la máxima categoría nacional, logrando como mejores clasificaciones tres terceros puestos a mediados de los años 90, y en 5 ocasiones en la segunda división. Su primer ascenso a 1ª división fue la temporada de creación del club (1980). Es el equipo más veterano en la máxima categoría ya que participa en ella de forma ininterrumpida desde 1990.
Por otra parte la sección masculina ha participado en la máxima categoría nacional en 10 ocasiones (actualmente desde 2003) logrando como mejor clasificación un quinto puesto en 1996. Su primer ascenso a 1ª división fue la temporada 1992 tras proclamarse campeón de 2ª división.
El mayor hito como club se consiguió en 1992 cuando el equipo femenino del Pamplona Atlético conquistó el título de la Copa de Clubes en Pista Cubierta (actual Copa de la Reina) en Zaragoza.
En los Campeonatos de Euskadi de clubes la sección femenina cuenta con 7 títulos al aire libre y 9 en pista cubierta mientras que el equipo masculino sólo tienen un título al aire libre.
Luis LANDA BALLAZ (2008)