La Orquesta de Euskadi posee asimismo un importante archivo sonoro, fruto de una intensa política discográfica centrada fundamentalmente en la producción sinfónica de compositores vascos. Así, entre cerca de cuarenta registros editados por sellos como Decca o RTVE Música entre otros, destaca la Colección de Compositores Vascos editada por la casa CLAVES con el apoyo del Grupo Mondragon, que supone la compilación de obras de autores vascos más importante realizada hasta el momento. Valentín de Zubiaurre ha sido el último nombre que se ha incorporado a esta colección, en la que figuran también Beltrán Pagola, Luis de Pablo, Juan Crisóstomo de Arriaga, Aita Madina, Tomás Garbizu, Aita Donostia, Pablo Sorozábal, Francisco Escudero, Andrés Isasi, Jesús Arámbarri, José Mª Usandizaga y Jesús Guridi.
Pero su vocación de dar permanencia a las obras maestras de la música vasca va más allá de esta colección, como demuestra la primera grabación de la ópera Gernika de Francisco Escudero, uno de los monumentos de la creación musical vasca del siglo XX. La Orquesta, además de dar pervivencia al patrimonio musical, fomenta su ampliación con el encargo regular de obras a creadores vascos, ya sean emergentes o consagrados.