Fue erigido en San Sebastián por el Sr. Obispo de la diócesis don Jacinto Argaya el 22 de diciembre de 1972. Sus antecedentes hay que buscarlos en los cursillos del año 1971 y su nacimiento como resultado de múltiples esfuerzos y diversas consultas, particularmente, al Consejo Presbiteral de la diócesis. Su finalidad consiste en ofrecer un servicio y una sede de reflexión teológica y pastoral a los sacerdotes, religiosos y seglares. Quiere, pues, servir a la comunidad cristiana en el esfuerzo común por descubrir y clarificar las líneas de pensamiento que han de iluminar la acción pastoral. Para ello, pretende partir de las inquietudes y aspiraciones percibidas en la misma comunidad, en la que el Espíritu de Dios está permanentemente animando al pensamiento y la acción de los cristianos. Para cumplir esa finalidad trata de estar en permanente relación con las necesidades de tipo doctrinal experimentadas en las comunidades cristianas, con el fin de responder a ellas en la medida de sus posibilidades. Las actividades académicas se desarrollan a base de cursillos, tanto en la sede del Instituto como en las distintas Zonas y localidades de la diócesis, organización de seminarios, mesas redondas, presentación de libros de interés teológico y actualidad pastoral, publicación de folletos, edición de libros y cualquier otro tipo de actividades coyunturales que incidan en las finalidades generales. El director del Instituto es el señor Obispo de la diócesis, asistido por un equipo de dirección y un equipo académico. J. M.ª Ferreras Orbegozo.