En la Caja Rural de Navarra la distribución de beneficios se ajusta a lo marcado por la legislación vigente. Dedicando una parte de los mismos al pago de intereses al capital de sus socios, otra al Fondo de Reserva Obligatorio y una tercera al Fondo de Educación y Promoción. Según la ley, debe dedicarse a este fin un mínimo del 10% de los excedentes de cada ejercicio. Durante el ejercicio 2001 se emplearon 2.177,36 miles de euros en este Fondo, que fueron distribuidos en las siguientes actividades:
Actividades Culturales y Recreativas, como Ferias, Congresos o Exposiciones y otras de carácter más popular.
Asesoramiento, Formación y Promoción Cooperativa, que es un Servicio de asesoramiento fiscal y de otras áreas ofrecido a sus clientes. A esto hay que añadir la edición de publicaciones de carácter divulgativo.
Obra Asistencial. Ayuda a las personas mayores, clubes de jubilados, subvenciones puntuales a Instituciones, Asociaciones y O.N.G..s, y promoción de cursos y actividades diversas.
Obra Docente, en la que se encuadra la Granja Escuela Haritz-Berri de Ilundáin y los convenios con las Universidades navarras.
Ayudas al Deporte. Patrocinio del Grupo Ciclista Caja Rural y distintas subvenciones al deporte popular de base y a diversos clubes deportivos.