Según I. Barandiarán, que las excavó en 1975 y 1976, en ellas se llevaron a cabo diferentes asentamientos de tipo prehistórico: en el primero (9900 al 9000 a. C.) las habitaron pobladores de la cultura Aziliense; en los segundos (6000 a. C.) las ocuparon seres humanos pertenecientes al Epipaleolítico; en la tercera etapa (período Atlántico) sus habitantes dejaron restos de cerámica; y en las últimas etapas (Neolítico y Bronce Pleno) las cuevas fueron empleadas como lugar de enterramiento.