Ex municipio alavés. Desde 1841 en que se separó de Valdegovía, Villanañe formó con Bellojin, municipio exento, regresando a la pertenencia de Valdegovía con las reformas municipales de 1923. Los censos registrados durante este período son 298 habitantes en 1843; en 1887, 217; en 1910, 306 y en 1920, 312 habitantes.