Exceptuando alguna obra como Sekulotan sekulorun, los trabajos que más nombre han dado a Patri Urkizu han sido las investigaciones sobre lengua y literatura.
En la década de los 70 publicó algunos ensayos breves como Literatura eta kritika [=La literatura y la crítica] (1970) o Euskal teatroaren historia [=Historia del teatro vasco] (1975). Precisamente el teatro ha sido uno de los géneros que más amplia y profundamente ha estudiado Urkizu. A estudios sobre el teatro popular pertenecen trabajos del estilo de Zuberoako irri teatroa: Astolasterrak [=Teatro cómico de Zuberoa: Astolasterrak] (1984) y Euskal antzertia [=El teatro vasco] (1984). El investigador lezoarra ha dado gran importancia a los materiales de la tradición oral vasca, hecho que se refleja en estudios como Bertso zahar eta berri zenbaiten bilduma (1798) [=Colección de algunos viejos y nuevos versos (1798) y la profunda investigación publicada en dos tomos con el nombre Bertsolaritzaren historia [=Historia del versolarismo] (1991). También caben destacar trabajos publicados últimamente como Balada zaharrez [=Sobre viejas baladas] (2005) y Agosti Chahoren kantutegia [=El cancionero de Agosti Chaho] (2006).
Urkizu también ha trabajado el género biográfico. Son obras suyas Garbizu anaiak: "Zubigar", "Iruzubi", "Tege" (1921-1936) [=Los hermanos Garbizu: "Zubigar", "Iruzubi", "Tege" (1921-1936) (1991), Claudio Otaegi olerkaria (1836-1890) [=El poeta Claudio Otaegi (1831-1890)] (1991, junto a Xabier Azurmendi), Jon Mirande. Orhoituz (1925-1972) [=Jon Mirande. Recordando (1925-1972) (1997), Anton Abbadia. 1810-1897. Biografia saioa [=Anton Abbadia. 1810-1897. Ensayo biográfico] y Maria Dolores Agirre eta euskal antzertia [=Maria Dolores Agirre y el teatro vasco] (2004).
En el ámbito de la investigación, junto a los materiales hasta ahora mencionados, Urkizu se ha encargado de preparar la edición de numerosos textos y colecciones de cartas. En la década de los 80 recopiló varios cuentos de Jon Mirande en la antología Gauaez parke batean. Ipuin izugarriak [=De noche en un parque. Cuentos terribles] (1984). Aquel mismo año publicó la obra teatral en forma de pastoral Santa Jenibeva (pastorala) [=Santa Genoveva (pastoral)]. Cuatro años después preparó la edición del Telemake (1988) de Jean Duvoisin y la de la novela de posguerra Antton de Jean Pierre Iratchet para la colección Klasikoak. Fue responsable, asimismo, de recopilar y editar los textos sobre literatura vasca de Piarres Laffitteren en Euskal literaturaz [=Sobre literatura vasca] y los artículos recogidos con motivo del homenaje a Patxi Altuna, profesor de la Universidad de Deusto. Se publicó con el título Patxi Altunari omenaldia [=Homenaje a Patxi Altuna] en 1990.
Como se ha indicado, Patri Urkizu también se ha ocupado de publicar trabajos y cartas inéditos de algunos autores vascos. Cabe mencionar el Azti-begia eta beste izkribu zenbait [=Ojo de brujo y algunos otros escritos] (1992) de Agosti Chaho, LVII.a gerlan [=LVII en la guerra] (1995) de Jean Elissalde, Jon Miranderen gutunak [=Cartas de Jon Mirande] (1995) y Erbestetik barne-minez: Andiba Ibiñagabeitiaren gutunak, 1935-1967 [=Desde el exilio con dolor interior: cartas de Andima Ibiñagabeitia, 1935-1967] (2000).
Mediante la Universidad Nacional de Educación a Distancia (UNED), por otro lado, Urkizu ha preparado y publicado algunos trabajos sobre lengua vasca y literatura: Antología de la literatura vasca: guía didáctica (1992), Historia de la literatura vasca (2000) -fue responsable de la edición y autor de uno de los capítulos del libro-, Introducción a las lenguas y literaturas catalana, gallega y vasca (2004), etcétera.
En 2004 el documentalista Borja Aginagalde halló el manuscrito del siglo XVI de Joan Perez de Lazarraga, que recogía algunos poemas y una novela pastoril incompleta. La primera edición en papel corrió a cargo de Urkizu, y se publicó aquel mismo año con el nombre Dianea&Koplak.