Sirvió de secretario o amanuense a Cristóbal Colón durante el viaje del descubrimiento de América y, en concreto, cuando llegaron al golfo de Paria, situado cerca de las bocas del Orinoco, Venezuela. Bernardo de Ibarra figura varias veces en el pleito que sostuvo el Fisco con D. Diego de Colón, donde declara Ibarra que en este viaje "escribió una carta que el Almirante escribiera al Rey e Reina, nuestros señores, haciéndoles saber las perlas y cosas que había hallado, y le envió señalado con la dicha carta una carta de marear los rumbos e vientos por donde había llegado a Paria..." Bernardo de Ibarra oyó decir que se habían hecho copias de dicha carta de la que luego se sirvieron otros en las navegaciones sucesivas. Ref. Ispizua, S. Historia de los vascos en el descubrimiento, conquista y civilización de América, I, p. 82. Bilbao, 1914.