Célebre obispo de Álava, el último de la Sede alavesa antigua. Benedictino, era abad de Leyre y ya gozaba de fama al ser nombrado obispo de Álava hacia 1066. De los veinte años largos de pontificado tenemos abundantes noticias; generalmente aparece confirmando donaciones de los reyes de Navarra y recibiéndolas. Poco después de haber consagrado Santa María de Valvanera en 1073, le vemos en Roma en delicada misión. Alarmada la iglesia vasca por querer el Papa Alejandro II suspender el rito mozárabe vigente en la zona alavesa, son comisionados Munio de Calahorra, Jimeno de Oca-Burgos y Fortunio para ir a Roma, donde tras examinar los libros doctrinales que traían, el "Liber Ordinum" de Albelda, el "Liber Orationum" y el "Liber Antifonarum" de Irache y el "Liber Missarum" de Santa Gema, Alejandro II ordena se deje de incomodar a estas diócesis por causa del particular rito que los comisionados demuestran totalmente ortodoxo. Al ser absorbida Álava por Alfonso VI de Castilla la actitud de Fortunio, aunque no muy clara, parece ser de no acercamiento al nuevo señor, manteniéndose fiel en lo posible a la monarquía navarra. En el 1087 dejan de aparecer noticias sobre Fortunio en las donaciones y demás documentos. Hay un período de silencio y ya no vuelve a aparecer obispo alavés alguno: Fortunio ha sido el último. Ref. Mañaricúa: Obispados.., Vitoria, 1964, p. 118.