Antiguo linaje navarro, procedente tal vez de Ultrapuertos. A Juan Martín le dio el rey y a Martín López o Lópiz, hijo de Juan, el molino de Vera de Bidasoa, en recompensa de unas mesnadas, en el año 1377. En 1399 Martín Lópiz se titulaba señor de Alzate. Los linajes de Alzate y Zabaleta se hacían la guerra en 1411. En 1414, el de Alzate estuvo desafiado por el de Lizarazu. En 1424 dio el rey a Juan de Alzate, su valet de cámara, cierta cantidad para comprar unos palacios en el lugar de Labiano. En 1426 dio el rey a los del linaje de Alzate las rentas de los molinos de Lesaca para sostén de los gastos que tenían en la guerra contra el señor de San Per (Saint-Pée, Lab.). Martín de Alzate, alcaide del castillo de Cáseda en 1428. En el mismo año los linajes de Alzate y Zabaleta volvieron a hacerse la guerra acerca del molino de Echalar. Sancho Alzate era alcaide del castillo de Laguardia en 1430. Pedro de Alzate, trinchante de la infanta doña Blanca en 1430. Sancho Sánchez de Alzate se obligó en 1431 a fabricar una fortaleza y torre en su ferrería de Uransate, y el rey le concedía, en su caso, libertad del pago de peajes y lezta. Esteban de Alzate y otros compañeros habían desafiado en 1431 a los de la villa de Tolosa, pero revocaron el desafío ante el rey de Navarra. Machín o Martín de Alzate era hidalgo de Belascoain en 1434. Sancho de Alzate, hidalgo de Olite en 1440. En 1441 era alcaide del castillo de Milagro. En 1450 Juan de Gamboa se titulaba señor de Alzate. Rodrigo de Alzate, hijo de Juan de Gamboa, fue agraciado en 1460 con el molino de Lesaca y la casa de Ibarburúa, con las sacas y peajes de las cinco villas. En 1513 Juan de Alzate, señor de la casa de Alzate, fue nombrado copero del reino de Navarra.