Donostiako nortasun politikoa, 1903ko azaroaren 17an jaioa, Pasaiako zurgin karlista baten eta zigarrogile oriotar baten semea.
La Salleko ikastetxean ikasi zuen eta 11 urterekin hasi zen lanean, hainbat ikaskuntzatan, zurgintzara bideratu zen arte. Luis anaia nagusiak ez bezala, anarkismo moderatua miretsi zuen, nahiz eta irakurketarekiko pasioa partekatu. Herriko Langile Elkarteen Federazioan sartu zen, berarekin batera. 1924an, zatiketa komunistaren aldeko hautua egin zuen, eta Zapirain anaiak Primo de Riveraren diktaduran propaganda egiten aritu ziren. Zuraren Sindikatuko idazkaria izan zen. Eraikuntzako greba batzordeko kide izan zen 1930ean, eta espetxeratu egin zuten.
1931ko udal hauteskundeetara aurkeztu zen Atochako distritutik. Errepublika aldarrikatu ondoren izan zen arrantzaleen greban atxilotu zuten, Luis anaiarekin batera. 1931-1932an Moskuko Leninista Eskolan ikastaro bat egin zuen. PCEren krisia lehertu zenean, Bulalejoseko politikaren aurrean Internazional Komunistaren jarrera hartu zuen eta SESBen jarraitzeari uko egin zion. PCEren IV. Kongresuaren ondoren, Bilbori esleitu zitzaion Euskal Herriko Federazioa norabide horretan bideratzeko zeregina betetzeko, eta bertako idazkari nagusi izendatu zuten. 1935ean Guadalupeko gotorlekuan atxilotu zuten, greba handiaren ondorengo Aliantzen eraketan parte hartzeagatik, eta handik hilabete batzuetara behin-behineko askatasunean utzi zuten, absolbitu zuen epaiketa militarraren zain. Fronte Popularraren garaipenaren ondoren (1936), Madrilgo "Mundo Obrero"-ko erredakzioan sartu zen.
Hiri horretan bizi da Angelina Santamaria euskal buruzagiarekin, gerra hasi eta herri armadako instruktore izendatu zutenean, eta gero Somosierrako frontean komisario politiko eta beste batzuk, besteak beste, Guadalajara, Brunete, Jarama, Andaluzia eta Katalunia. Errepublikaren eremua moztuta, Valentziara eta Cartagenara igaro zen, eta han antolatu zuen PCEko jendearen ebakuazioa, aireportu militarra hartuta. Estatu Nagusiko Brigadako komisarioa da, koronelaren maila berekoa. Oranen lehorreratu zen eta beste askorekin batera kontzentrazio esparruetan giltzapetu zuten Frantziara bidali arte, handik SESBera eta honetatik, misioan, Txilera eta Argentinara.
Dora Trumper argentinarrarekin ezkondu zen 1943an, eta alaba bat izan zuten. 1944an alderdia Espainiara berrantolatzeko misio klandestinoan doa, 1945eko abuztuan sarekada batean erori arte Santiago Alvarezekin batera. Gertakariak nazioarteko kanpaina piztu zuen, eta atxilotuak heriotza zigorretik salbatu zituen. Hamar urtez egon zen Zapirain Palentziako espetxean, eta handik gutxira eman zuten, Espainiara joandako emazte eta alabarekin batera, Mexikora lehenengo, Uruguaira gero.
Alderdiak Txekoslovakiara bidali zuen gero, PCEko Batzorde Zentraleko kide gisa eta Roque Sergio izenarekin. 1956ko udan Paristik Euskadiko PCa biziberritzeko agindua eman zioten, Luis anaiarekin batera, baina biak atxilotu, epaitu eta kanporatu egin zituzten Txekoslovakiara joanda. 20 urte egingo ditu herrialde horretan, SESBekoa ez beste PC guztietako egoitzak ordezkatuta zeudela, "Revista Internacional" delakoan eta borroka antifrankistan lan eginez.
1979an itzuli zen Donostiara, Euskadiko eta Espainiako PCko ohorezko kide eta CCOOko militante gisa. 1993an, bere alaba bakarra, Aurora, eta hiru biloba Errusiatik itzuli eta Donostian bizitzea lortu zuen, emaztearekin batera. 1996ko urtarrilaren 18an hil zen hiri horretan, 92 urte zituela. Erref. Jiménez de Aberásturi, Juan Carlos: Euskal historiaren protagonistak: Sebastián Zapirain, 6. Saileko Koadernoak, Historia eta Geografia, Eusko Ikaskuntza, 1985, 105-190. Politikari beteranoari egindako elkarrizketa luze eta aberatsa, Euskadiko eta Espainiako PCari buruzko datu ugari azaleratzen dituena.