Según el censo agrario de 1972, en este ayuntamiento había 198 explotaciones agrícolas, 3 de ellas mínimas, 4 de menos de 5 Ha., 2 de 0,5 a 0,9 Ha., 25 de 1 a 5 Ha. , 39 de 5 a 20 Ha., 113 de 20 a 100 Ha. , 12 de 100 y más Ha. El régimen de tenencia era el siguiente: Propiedad: 1.567; Arrendamiento: 2.489 Ha.; Aparcería: -; Otras: 5.614 Ha.; 2.925 parcelas eran menores de 1 Ha., 870 de 1 y menores de 5 Ha., 123 de 5 Ha. y mayores. Poseía 3.722 Ha. de monte de utilidad pública y 2.209 de monte particular. La superficie labrada por tipos de cultivos era en 1970 como sigue:
| | Hectáreas |
| Trigo | 1.700 |
| Cebada | 1.500 |
| Avena | 300 |
| Patata | 500 |
| Huerta | 5 |
| Maíz | 5 |
| Alholvas | 10 |
| Alfalfa | 10 |
| Esparceta | 10 |
| Remolacha forrajera | 20 |
| Forrajeras | 10 |
Las producciones de los diferentes cultivos eran:
| | Kilogramos |
| Trigo | 4.250.000 |
| Cebada | 3.000.000 |
| Avena | 450.000 |
| Patata | 7.000.000 |
| Maíz | 5.000 |
El censo ganadero en 1970 era el siguiente:
| Vacuno | 700 |
| Ovino | 2.500 |
| Porcino | 1.200 |
| Caballar | 50 |
| Mular | 20 |
| Gallinas | 7.500 |
| Conejos | 2.000 |
| Colmenas | 100 |
En 1986, con el ingreso en el Mercado Común, fue declarado este municipio "zona de montaña" haciéndose acreedor a un subsidio del 50 % sobre el proyecto de desarrollo integral del mismo. Desde el punto de vista comercial, San Millán pertenece al área de Vitoria-Gasteiz.
