Erdi Aro musikala amaitu da ahots musikaren garaipena prestatzen hasi denean, musika tresnek soinuaren munduan duten parte-hartzea alde batera utzita. Dunstable eskoziarra Londresen hil zen 1453an, eskola polifoniko eta flamenkoari bidea irekita utzita. Dufay musika-tresna lagungarrietatik bereizten hasi zen eskola horretan, eta Ockeghemek behin betiko utzi zuen musika polifonikoa konposatzen Frantziako gortean 1452tik aurrera. Ahots polifonia independente eta arrakastatsuaren mundu horretara iritsi da Josquin des Pres, gure Joanes de Anchietaren garaikidea, 1523an Azpeitian hil zena, flamenkoaren bi urte geroago. Aldaketa seinalatu horiek iraultza ekarri dute musikaren teoriaren alorrean. Hain zuzen ere, 1450ean jaio zen Bartolomé Ramos de Pareja espainiarra, berritzailea, eta harekin elkartu zen Gonzalo Martínez de Bizcargui azkoitiarra. Beste batzuekin batera, Gioseffo Zarlino teorialari handirako bidea prestatu zuen, 1558 aldera eskala temperatua sortu baitzuen; orduan hasi zen polifoniaren urrezko aroa, Palestrina, Lassoren lan hilezkorrekin. Hau, hiru musika-jenioen artean gazteena, 1611n hil zen azkena, garai barrokoari ekin zionean. Garai horretan, berriz ere garrantzia hartu zuen musika-genero berri bat, opera eta organoaren garaipenak.
Musika polifonikoak nekazari asko izan ditu Euskal Herrian. Katedral eta eliza nagusiek XV. mendean zuten musika polifonikoa jotzeko kapera. Eta gure konpositoreak musika-genero berri horren laginak ematen ari ziren. Gogora dezagun, aurrekari baliotsu gisa, José de Anchorena nafarra, 1436an Iruñeko katedraleko kantortzikoen maisu izan zena, misa- eta salmo-musika konposatu zuena. Bere konposizio ugarietatik, gehienak Burgosko katedralean kaperako maisua izanik, Salbe bat eta Stabat Mater baten zatiak gordetzen dira. Baina garai polifonikoak berrikuntza garrantzitsu bat dakarkigu, lehenago ere aipatua: Iruñeko musika-zentroa nagusitasuna galtzen hasi da, eta herrialdeko beste leku batzuetan musika-albisteak ugaritzen hasi dira.
Deszentralizazio horretan jaloi bat markatzen dutenak oso leku eta denbora gutxian jaiotako gipuzkoar bi dira: Gonzalo Martínez de Bizcargui, teorikoa, Azkoitian 1460an jaioa, eta Joanes de Anchieta, polifonista, Azpeitian 1463an jaioa. Lehenengoari buruz ziur dakigu Burgosko katedralean kaperako maisu izan zela eta horretarako obra polifonikoak konposatu zituela. Baina batez ere musikaren teoriatik atera zen, 1511. urtean Arte de Canto Llano eta Contrapunto e e canto de órgano lanarekin. Sei edizio merezi izan zituen XVI. mendearen lehen erdian. Haren heriotzaren ondoren, 1530ean gertatua, bigarren lan bat argitaratu zen, teorikoa ere, Intonazioak modernoen erabileraren arabera (Zaragoza, 1538). Gonzalo Marínez de Bizcargui izango da, seguruenik, musikaren teoriaren alorrean Europan garrantzia duen lehen euskal musikari izendatua. Musikologiaren arlo horretan, Martín de Azpilcueta, Navarrus doktorea (1492-1586), Barasoainen jaioa, urte askoan Orreagan monjea eta gero hainbat unibertsitatetan irakaslea izan zen, besteak beste Erroman, non agure bat hil baitzen. Bere lan juridiko eta moral ugarien artean, izenburu luzeko musikarekin zerikusia zuen bat idatzi zuen: Musika eta kantu figuratozkoak. II. silenzio beharrezkoa nell'altare, nel coro ed altri luoghi ove si cantono i divuffizi.
Euskal polifoniaren ordezkari adierazgarriena, zalantzarik gabe, Joanes de Anchieta da. Haren irudia gure mugen barruan eta kanpoan aztertu da, eta Barbieri, Pedrell, El Padre Donostia, Imanol Elías, Robert Stevenson, Adolphe Coster eta beste batzuek eskainitako monografiak nabarmendu dira. Zalantzarik gabe, bere lehen musika-prestakuntza herrialdean lortuko luke, eta Hernández Ascunce da, lehen urteetan Iruñeko katedraletik pasatuko litzatekeena. Egia esan, nahiz eta eliz Nafarroako hiriburukoa izan, politikoki Gaztelako gortearen mende zegoen, eta handik, 1489an, Errege Katolikoen kantari eta kapilau musikariarentzat eskatu zuten. Baina 1503an Azpeitiko jaioterrian aurkitu zuten berriro, Soreasuko Donostiako errektore gisa, Flandesera joan eta eskola polifoniko, erlijioso eta profanoarekin harremanetan jarri ondoren. Baina gauza jakina da garai hartan doinu herrikoiak erabiltzen zirela ahotsetarako, nahiz eta eduki erlijiosoa izan. Obra horietako batean Zortzikoren erritmoa agertzen da, Anchietak idatzia.
Anchietaren garaikidea Josquin des Pres izan zen, lau ahotseko meza batean kanta bat erabili zuena. Kantu horrek, gutxienez, gure herrialdearekin zerikusia duen izenburua izan zuen: Bisquayeren moussea eta bertso bakoitzaren amaieran errepikatzen den euskarazko esaldi bat: soaz, soaz, ordonarequin edo "vete, vete, en buena hora". Besteak beste, Enrique Jordá Gallasteguik Euskal Herriko kanta, dantza eta musikarien liburua (1978) eta Francisco Javier Oroz Arizkurenek Navicula Tubingensis. Studia in honorem Antonü Tovar (Tubingen, 1984).
XVI. mendean, euskal polifonisten zerrenda oparoa aurkezten zaigu. Polifonistak ez dira bakarrik herrialdean bizi, baizik eta kolegiatetan eta kanpoko katedraletan bizi dira. 1516an Iruñeko katedraleko kapera berritu zen eta Juan de Uriz eta Esteban de Miguel Kaperako maisu eta organista karguak bete zituzten, hurrenez hurren. 1520an, Pedro Ibáñez de Gamboa Arrasateko Capilla, Hondarribiko Andrés de Sylva eta Oiartzungo Joanes Larrumbide maisuak dira. 1542an Iruñeko Juan Arteche Legariako Kaperako maisu izendatu zuten, Otsagabiako Fortuño Ibáñez de Salazar (1572) eta Juan de Aldaba, eta Miguel de Echarrenekin amaitu zuen mendea. Miguel Navarro ere deitzen zioten (1563-1627), eta Aurelio Sagasetak aztertu du (1983). Bilboko Santiago Basilikan 1577an Prudentzio Navarro eta 1586an Domingo Matanza agertzen dira, udalerriak mantentzen duen musika kapera batekin. Herrialdetik kanpo Hernando Isasi (1564) eta Avila (1587), Diego Alvarado (Lisboa) eta Diego de Burceña (Burgos) daude (1601).
XVI. mendean zehar, euskal organogile eta organo-joleen izenak ere ugariak dira. Arrasateko organoak, 1448an erre zirenak, ordurako ordezkatuak ziren eta 1507an Domingo Ibáñez de Echebarria "organo-sonadore" gisa agertu zen. Urte horretan Lezon Flandesen eraikitako organo bat jarri zen. Ondotxo dakigu Azkoitian organo eta organo-jotzaile bat zegoela 1508an, herri hartako "organo-suntsitzailearen" aurka jarritako auzi batengatik. 1522an Nafarroako organogileen historia Juan Martinezekin hasi zen, Cascanten lantegia zuela. Ikus dezagun hemen XVI. mendean aurrerapen handia gertatu zela tresna hori eraikitzeko teknikan. 1528an, Bizkaian erregistratutako lehen organoa dugu, Balmasedan, eta 1556an organo-jole izendatu zuten, Lope de la Cruz. Iratxeko monasterioak 1536an du bere organoa. Euskal organo-joleen ospea gure mugetatik haratago doa, 1560an Pedro Ximenez de Oñate agertu baitzen Karlos V.aren organo-egile gisa. Egun horretan bertan, Azkoitiko Santa Maria Sebastian de Lasaoko organo-jolea da. Bizkaiko organogileen eskola Urduñako Vicente Albertorekin sortu zen. Markina eta Azkoitiko organoak eraiki zituen 1578an eta 1579an, eta Nafarroako eskolak Guillaume de Luperekin jarraitzen du, besteak beste Tafallako Santa Maria organoa eraiki zuelarik. Eskola honek sekulako distira du Lerinen, non XVI. mendean hamabi organogile dauden.
Baina organoaren benetako garaipena XVII. mendean etorriko da, musika barrokoarekin batera, instrumentu laguntzaileei nagusitasuna ematen hasi baitzen berriro. Monteverdik (1607) Orfeo opera estreinatu zuenean, musikaren garai berri bat hasi zen, ehun eta berrogeita hamar urte iraungo duena, Juan Sebastián Bach 1750ean hil zen arte. Ahots musikaren monopolioak, 1483an Sixtina Kapera sortu zuen Apezpikuak bultzatuta, instrumentuen akonpainamendua uzten du, organo edo orkestrarena. Herrialdeko musika-kaperak estilo berriaren arabera antolatzen dira, eta instrumentu laguntzaileak (sokakoak eta haizekoak) eta organo onak izaten dituzte. José Goñi Gaztambidek Iruñeko Katedraleko Musika Kaperaren azterketa aurkeztu digu, hasieratik (denboran zehaztugabeak) 1600 arte (1983). 1589an indarrean jarri zen zeremoniari eta haren jarduerei buruzko araudi osoa. Baionako katedralari dagokionez, Henri de Bethune gotzainak 1629an sortu eta arautu zuen bere musika-kapera, eta Jean d'Olce gotzainak bultzada nabarmena eman zion 1646tik aurrera. Garai honetan antolatzen den beste musika-kapera bat Arantzazuko santutegia da, 1616an Aita Zerain zaindariak sortua; 1634an organo-jole bat, baxoi bat eta korneta bat zeuden bertan, eta hamar haur kantari. Beste kapera bat ere bazegoen Orreagan, eta handik, 1642an, Egui kapilaua Arantzazura bidali zuten "beheitia jotzen ikastera".
Garai hartako konposizio erlijioso asko oinarrizko orkestrarekin idazten dira eta bakarlarientzako kantata batzuk idazten hasten dira, Europan bezala. Lehen adibidea Inclyto Apóstol de la Cristiandad Moderna izeneko lana izan liteke, 1622an Tafallako Miguel Errea katedraleko kaperako maisuak San Frantzisko Xabierkoaren ohorez konposatutako solo, koru eta orkestrarako. Musika estilo berri horrek kapera berrantolatzera behartzen du eta, horrela, 1626an, Iruñeko katedralaren estatutuen zati bat kaperaren diziplina arautzen du. Egun horretatik aurrera, arpisten, erlaitzen, beheitien eta bestelako instrumentisten izenak agertuko dira. Baina laguntzaile nagusia organoa da, eta garrantzi handia du. Hogeita hamar urteko tartean hamaika organogile topatuko ditugu Espainian: Joseph Eizaga Echebarria, Juan Bautista Telleria, Pedro Echebarría, Ventura Chavarria, Jacinto del Río, Nicolás Bristet, Cipriano Apecechea, Antonio Bidarte, Félix Yoldi, Francisco de Olite eta Jerónimo Roch mallorcarra. Organogile horiek eraikitako instrumentu bat bera ere ez da erabili; izan ere, horietako gehienak, urte batzuk geroago benetako bitxiak izango zirela kontuan hartu gabe, suntsitu egin zituzten eta modernoago batzuek ordeztu zituzten. Garai hartakoa da Bastidako organoa, 1635ean eraikia. Esan dezagun, halaber, aipatutako organo-egile batzuek organoak muntatu zituztela Euskal Herritik kanpo.
XVIII. mendeko euskal organogileen nomina ere zabala da, eta adierazten du gure eliza gehienek beren zerbitzuak kontratatzen zituztela organo on bat izateko. Domingo de Aguirre, Matías Rueda, Lucas eta Ramón de Tarazona, Guillermo eta Juan Monturus, Teodoro eta Francisco Antonio Arrazain, Santiago Erdoiza, Antonio de San Juan, orain Aieteko organo zaharberritua, Lorenzo Arrazola, eraikiko duena, Ataunen seme berritua 1761ean, Diego eta Diego. Beste organogile famatu batzuk XIX. mendearen hasieran hasi ziren Pedro Roquesekin.
Baina itzul gaitezen XVII. mendera. Organogileekin gertatzen den bezala, ezin dira hemen izendatu garai barrokoko euskal musikari guztiak, kapera-maisuak, organo-joleak, konpositoreak, etab., zerrenda zehatza, beste lan batzuetan aurki daitekeena (Música y músvascos, del Padre Donostia, edo mi Música Vasca). Hala ere, komeni da batzuk nabarmentzea, beren lanengatik gure mugetatik kanpo ospea merezi izan duten pertsonaia musikalak direlako. Hori da Pedro de Tafallaren kasua, 1623an El Escorialeko monasterioko kapera maisua baitzen. Fray José Vaquedanok, Madrilgo Enkarnazio Komentuan Kaperako maisu izan ondoren, kargu bera hartu zuen Santiagoko katedralean, eta han hil zen 1711n. Miguel Irizar Kaperako maisu izan zen Segovian 1671n eta Manuel Egues Burgosen 1685ean. Simón Martínez Ochoa, Calahorrako katedralean organo-jolea izan ondoren, Capillako maisu izan zen 1716an Astorgan.