Esta villa ya en el siglo XII tenía señor particular (Ref. «Diccionario Geográfico-Histórico de la Real Academia», t. I, p. 263). A mediados del siglo XIV era señor de la villa D. Diego Hurtado de Mendoza (Ref. «Geografía General del País Vasco-Navarro», t. Álava, p. 474). A fines del siglo XV el conde de Orgaz vendió el señorío de esta villa al obispo D. Diego de Álava y Esquivel, cuyos herederos continuaron disfrutando la posesión del señorío hasta mediados del siglo XVIII, en que les fue secuestrada por la Corona la legítima posesión del mismo. Desde entonces dejó de pertenecer a un determinado señor. (Ref. «Gegrafía General del País Vasco-Navaro», t. Álava, p. 474). En un documento de 1468 consta cómo fue otorgado por el pueblo de Mendoza un poder para un compromiso sobre disputas acerca de límites de pastos. Como consecuencia de ello en 1470 se hizo el Instrumento de Compromiso. En ambos documentos se la llama Aldea y Lugar de Estarrona. Esto mismo se reconoce en la aprobación que hizo esta villa del Instrumento de Compromiso del 7 de marzo de 1480. Aunque en tales documentos no se la titula "Villa de Estarrona", se aprecia que tenía en tal tiempo judicatura ordinaria, independiente, como correspondía a las poblaciones que gozaban del título de villa. En estos mismos documentos se hace constar cómo era señora de la localidad D.ª Leonor de Manrique. (Ref. Joaquín José de Landazuri: Compendios Históricos de la Ciudad y Villas de Álava, Vitoria, 1928, p. 88).