(1829-1907). Médico y euskerólogo, natural de Eibar.
Ejerció su profesión en su villa natal durante 50 años, destacándose en la introducción de modernas normas de higiene y en las campañas de vacunación contra la viruela.
Su hijo Ciriaco fue otro destacado médico de la villa armera. Colaboró con estudios lingüísticos en Euskal-Erria, bajo el seudónimo de José de Guisasola. Mantuvo relaciones con Luis Luciano Bonaparte. Era un hombre excesivamente influenciado por Astarloa y escribió una obra, recompuesta de sus artículos en Euskal-Erria (entre 1882-1887), bajo el título "Tentativas de reconstrucción de nuestro lenguaje natural y el problema de la palabra" (Eibar, 1898), y que mereció duras críticas. Se cuenta que Miguel de Unamuno le escribió una carta donde decía: "Su libro es a la lingüística actual, lo que la astrología de antaño a la astronomía de hoy. Lástima de ingenio malamente empleado", y de forma similar le trató en su trabajo Sobre el cultivo del vascuence (Ver Unamuno, Obras completas, t. VI, 255. Madrid, 1958). Recibió análogas réplicas por parte de Julio Cejador, del cual, a su vez, Aguirre tomó revancha cuando aquél publicó su estudio lingüístico, con una "Carta abierta a D. Julio Cejador y Frauca" y "Examen crítico", en Euskal-Erria (t. LV, 280, 1906), donde resume sus teorías y acusa a Cejador de plagiario de algunas ideas suyas. No obstante, en su obra se recogen ideas y observaciones aprovechables, aunque verdaderamente creemos que sus actividades médicas fueron más afortunadas. Era poseedor de una rica biblioteca y un archivo de correspondencia con lingüistas de diversos países, entre los que se contaba el Príncipe Bonaparte. De dicha biblioteca no se salvó nada de la quema de la última guerra.
- Periódico "El Eibarrés", n.° 2 (Semblanza biográfica de autor anónimo). Eibar, 1919;
- San Martín, Juan: Mogel, Agirre ta Galdós, Eibartar euskelrzaleak. Revista "Eibar", n.° 27, 10, 1958.