En 1657 descubrió este Salcedo en Laycacota una riquísima mina de plata en sus terrenos, próximos al lago Titicaca. Otros colonos intentaron arrebatarle la mina que lo había enriquecido. Salcedo derrotó a los asaltantes. El virrey Diego de Benavides, conde de Santesteban, envió una fuerte columna para acabar con estas luchas. Pero Salcedo y los suyos lo derrotaron. "Afirman los contemporáneos que tal era la riqueza del "sublevado", que sus hombres, una vez agotados sus proyectiles ordinarios, disparaban con balas de plata". Al parecer, el virrey, atraído por la riqueza, lo trató como "sublevado". El 17 de marzo de 1666 murió el virrey, quedando como gobernadora la Audiencia de Lima, cuyo presidente era don Bernardo de Iturrizarra.
El nuevo virrey, conde de Lemos ataca a los Salcedo. El gobernador designado por la Audiencia se había dejado dominar por José Salcedo que ostentaba el cargo de Justicia Mayor. El virrey se lanzó a imponer su orden organizando una expedición a cuyo frente se puso "atacando con denuedo a los revoltosos", que venció. Seguidamente hizo ejecutar a más de cuarenta, entre ellos a José Salcedo, no obstante su cargo de Justicia Mayor. La indignación llegó hasta la corte, "hasta el punto de que el Rey vióse en la necesidad de dar satisfacción a los deudos del infortunado justicia mayor". Existe un Memorial de la Diputación del Reino (de Navarra) a la Reina pidiendo el castigo de los delincuentes en la rendición y excesos cometidos por Gaspar de Salcedo y Juan de Salazar en los reinos del Perú, que murieron muchos navarros y vascongados y perdieron sus bienes. Pamplona, 1668.