Konpainiari mozkin-tarte handiena eman zion eragiketa kakaoaren trafikoa izan zen, eta, nahiz eta tabakoaz ere interesatuta izan, holandarren eskuetan jarraitu zuen. Kakaoari dagokionez, nahikoa da datu batzuk gogoratzea: Konpainiaren lehen etapan, 1730eko hamarkadan, fanega kakaoa Caracasen erosten zuen 6 edo 8 pesoko prezioan. Penintsulako salmenta-prezioa, berriz, 50 edo gehiagokoa zen, eta horrek irabazi marjina handia zekarren, bai eta kontsumitzaileentzat ere. Kontsumitzaileek ikusi zuten merkatuko prezioa jaitsi egin zela, urte batzuk lehenago Amsterdam bidez iritsi zenarekin alderatuta. Gipuzkoarren jarduera pribilegiatua zela eta, gehiegikeriak egin zituen, hala nola kakaoaren erosketan prezio baxuak ezarri zituen (kalitatearen arabera 6-8 peso fanega), eta metropolian, berriz, 50 baino gehiagori saldu zien, jardueraren lehen etapan. Arrazoi horiengatik eta beste batzuengatik, 1748-9 artean Gipuzkoarraren aurkako matxinada izan zen. Altxamendu horretan, beste interes batzuk ere izan ziren, ingelesak kasu, Charles Knowlesen agindupeko La Guaria (Karakoko kostaldeko sarrera nagusia) hartu zutenean porrot egin zutenak, eta Gipuzkoarraren aurkako altxamendura gonbidatu zituen bertako biztanleak, eta Konpainiarekin zituzten baldintzak baino hobeak agindu zizkieten.
Kexen eta, batez ere, matxinadaren ondorioz, erregeak aldi baterako eten zuen Gipuzkoarraren jarduera, egozten zitzaizkion abusuak egiaztatu arte. Bi urteren ondoren, jarduerari ekin zitzaion berriro, baina Konpainiarentzat aldaketa batzuekin. Horrela, merkataritza-sozietateak prezio batzuk ezarri behar zizkion kakaoari, bai kolonian erosteko (13-14 peso fanega), bai metropolian saltzeko (33-35 peso). Hala ere, kakaoaren negozioak oso emankorra izaten jarraitzen zuen.